BLASTN 2.2.3 [May-13-2002]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= BA0AB024D04LP1|AL428204
(1048 letters)
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
1807 sequences; 10,358,551 total letters
Searching....done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
3x_Contig1574 2050 0.0
>3x_Contig1574
Length = 8021
Score = 2050 bits (1033), Expect = 0.0
Identities = 1038/1041 (99%)
Strand = Plus / Minus
Query: 3 atgaagctcaaacaacaacaaatgcagagatctcagacgcagcagcaacaggagccacga 62
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Sbjct: 2372 atgaagctcaaacaacaacaaatgcagagatctcagacgcagcagcaacaggagcaacga 2313
Query: 63 gctcagcaggtgcaacaagcccagcaattgcaacaacagcaggttcaacagcaacagcag 122
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Sbjct: 2312 gctcagcaggtgcaacaagcccagcaattgcaacaacagcaggttcaacagcaacagcag 2253
Query: 123 cagtctcctccccaatctcaacaacgaacttctttgaatcttcctccacaaattgcacaa 182
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Sbjct: 2252 cagtctcctccccaatctcaacaacgaacttctttgaatcttcctccacaaattgcacaa 2193
Query: 183 ctatcaccggcattgcaaatgcaatggcttcagtccatcaaacaacaggctattgcgaga 242
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Sbjct: 2192 ctatcaccggcattgcaaatgcaatggcttcagtccatcaaacaacaggctattgcgaga 2133
Query: 243 aataaccagaacgctcttctgatgatcactcagcttgaagtcaaattacagcaacaacat 302
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Sbjct: 2132 aataaccagaacgctcttctgatgatcactcagcttgaagtcaaattacagcaacaacat 2073
Query: 303 agacagcaacagcaacagcaacaacagcctgtaccaccacaacaacctgttcagcagcaa 362
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Sbjct: 2072 agacagcaacagcaacagcaacaacagcctgtaccaccacaacaacctgttcagcagcaa 2013
Query: 363 caacatcaatccccgccacgcaacattattcctcctaaccaaccgcagcttcaacagcct 422
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Sbjct: 2012 caacatcaatccccgccacgcaacattattcctcctaaccaaccgcagcttcaacagcct 1953
Query: 423 caacctcagaaacctcgtataccacttcagcaacaaatggggaatccacaacaaatgatt 482
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Sbjct: 1952 caacctcagaaacctcgtataccacttcagcaacaaatggggaatccacaacaaatgatt 1893
Query: 483 ggaggtcaacctataactcagaatataccagttatgaacagtaatcaatcgatggttcct 542
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Sbjct: 1892 ggaggtcaacctataactcagaatataccagttatgaacagtaatcaatcgatggttcct 1833
Query: 543 tcgtcacaacagccacaatcacaaccaccacaaccaccacaacgacaaccaccacaacga 602
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Sbjct: 1832 tcgtcacaacagccacaatcacaaccaccacaaccaccacaacgacaaccaccacaacga 1773
Query: 603 caacaacaacaacaagtcccagtttcagtaccacagccacctcaaccatcacaagctgca 662
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Sbjct: 1772 caacaacaacaacaagtcccagtttcagtaccacagccacctcaaccatcacaagctgca 1713
Query: 663 atactacagcaagtgcttcagaagtttcagaaacaacttcctgatattcccaaattccaa 722
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Sbjct: 1712 atactacagcaagtgcttcagaagtttcagaaacaacttcctgatattcccaaattccaa 1653
Query: 723 actattcttcaagacccacctgagactccattacctcatactaggttatggtcagagaaa 782
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Sbjct: 1652 actattcttcaagacccacctgagactccattacctcatactaggttatggtcagagaaa 1593
Query: 783 gaaagagctgataacgagcctgtgagttttgatacaagattatatgaacatgttattgaa 842
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Sbjct: 1592 gaaagagctgataacgagcctgtgagttttgatacaagattatatgaacatgttattgaa 1533
Query: 843 cgggatttgttggataaggacaacttgttggcggacactaatggattggaacctatttcc 902
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Sbjct: 1532 cgggatttgttggataaggacaacttgttggcggacactaatggattggaacctatttcc 1473
Query: 903 aaattcggattcagtcagagggaggtaatattgagattacagcaagatcttgattattac 962
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Sbjct: 1472 aaattcggattcagtcagagggaggtaatattgagattacagcaagatcttgattattac 1413
Query: 963 aaagaattgaggracagtcgaatgcaatccattaccaacacaactcaaggrcataaatct 1022
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Sbjct: 1412 aaagaattgaggaacagtcgaatgcaatccattaccaacacaactcaaggacataaatct 1353
Query: 1023 aagagtatatggggtgacggt 1043
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Sbjct: 1352 aagagtatatggggtgacggt 1332
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
Posted date: Nov 27, 2002 12:23 PM
Number of letters in database: 10,358,551
Number of sequences in database: 1807
Lambda K H
1.38 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.38 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 10,212
Number of Sequences: 1807
Number of extensions: 10212
Number of successful extensions: 648
Number of sequences better than 1.0e-20: 1
length of query: 1048
length of database: 10,358,551
effective HSP length: 16
effective length of query: 1032
effective length of database: 10,329,639
effective search space: 10660187448
effective search space used: 10660187448
T: 0
A: 40
X1: 6 (11.9 bits)
X2: 15 (29.8 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 51 (101.7 bits)